《平家物語》相傳是信濃前司行長在皈依佛教後傳給生佛盲僧（琵琶法師）的軍史小說，經過了漫長的口傳後，現今流行的是以沙門覺一一派為基礎翻譯的版本。《平家物語》在故事上雖然着重于平家盛極轉滅亡的十年間發生的奢靡、戰争與死亡，但是整體時間線長達數十年。并且《平家物語》不僅語言體系複雜，叙述方式也兼用傳記體與編年體。比如說動畫第二集裡的《祇王》便是以傳記體寫下了祇王與佛的故事，而在《額打論》、《清水寺炎上》則以編年體的方式講述了延曆宇興福二寺的争執。這大概也是科學猴在處理整部動畫時，刻意設定了年幼琵琶經曆現在、預知未來和年長琵琶傳唱過去的雙重叙述的原因之一吧。科學猴團隊在處理（叙述方式複雜、時間線不統一）這個問題的時候，選擇了一個非常讨巧的方式，那便是讓傳唱者的琵琶法師變成了“經曆者”。由此一來，以生佛法力預知未來、唱誦過去顯得更為合理，更使動畫中第一人稱視覺顯得更為合理。在這一層面來說，科學猴處理的非常巧妙。
可問題在于，要将原本不存在于原作中的人強行插入，又不改變故事的叙事主軸，就會使琵琶在劇中顯得非常的突兀與矛盾——特别是動畫又将琵琶作為劇中的主角（第一人稱視角）進行創作，此處即是動畫創作的慣性，又是商業上（針對受衆）的讨巧。琵琶的矛盾在于少女琵琶受重盛救命、養育之恩卻看着他死去、眼睜睜看着她喜歡的德子死去卻沉默不言。如果以經曆滄桑的成人僧侶來說倒顯得合情合理，但是一個少女琵琶，在劇中看起來情感豐富，天真可愛卻又對人之生死異常殘酷。單純用開頭的“殺父之仇”和“父命如山”來解釋有些牽強了。
另外暫時失去了湯淺監督的科學猴團隊以前兩集的叙事來看，在創作上仍然顯得過于“保守”和“正統”。特别是第二集中沒有展現出平清盛對祇王的冷血無情，一切看起來也是平淡如水，和樂融融。事實上《平家物語》中有許多流淚和各種死亡的描述。在《祇王》裡，祇王和佛都是有情有義之人，卻因為平清盛莫名其妙的蠻橫，造就了兩人的“悲劇”。祇王被趕出府邸，天天以淚洗面，被威脅去給佛解悶，去了也隻讓在下坐等候。佛想請祇王來房中或者出去接見，卻被清盛回絕。自己跑去找祇王讓她唱歌。祇王邊哭邊唱，竟然讓清盛甚為開心。後來祇王一家出家，佛也在内疚、恐懼中出逃，找到祇王一家懇請原諒并提出一起修行，這才抛棄了塵世雜念，共同前往極樂淨土（詳細讨論中有寫到）。因此我們也可以看出，科學猴仔進行處理的時候，選擇了更溫和的方式。平清盛霸道跋扈的形象也被塑造成了一個“老頑童”的形象。在這些處理上，可能會對閱讀過原著的人産生一些觀賞上的隔閡。說白了就是進行了低齡（全年齡）化的處理。不知道後續面對平家各人死亡的時候，會如何處理。
不過既然是改編，自然就會混入創作團隊本身對故事的思考和解讀。《平家物語》動畫版的整體質量優秀，可稱為佳作。無論是視覺藝術上還是配樂、故事發展上來看，都是不愧于科學猴名聲的質量，也讓很多動畫制作公司難以望其項背。日本古代社會的動蕩、貴族與武士的矛盾、日本佛教的政治、武裝鬥争，戰争與世間風情在接下來的半年内讓我們用最輕松的方式去享受也不失為一種樂趣。
