...基础理论：世界线理论。可以想象除Okabe以外的所有人都是NPC，当Okabe进行时间旅行时，相当于一个玩家在S/L存档，周围的NPC并不会查觉到这件事情，而Okabe（玩家）作为观测者，则拥有超脱时间线的真线性记忆。自始至终只有一个存档，即不存在平行世界。
世界线收束的本质前提是时间旅行的存在！即，一件事情的结果可能发生在其原因之前。
例如在（主要篇幅的）alpha线中，正是因为从2035年来的Suzuha的时间机器降落错了地点，砸坏了大楼，导致研讨会没有举行，因此Kurisu没有被父亲刺杀，并遇到了主角，加入到时间机器的研究中，最终导致了SERN盗窃研究果实统治了世界，在这个情形下Suzuha才成为了Valkyrie的成员，坐时间机器回到了过去试图避免这场灾难的发生（尽管她回到2010年的动机只是为了找爸爸，1975年才是正事），因此才救了Suzuha的生命。
暂且不讨论这个故事中存在的Bootstrap悖论。有一个关键事实并没有在故事中明说，但是几乎可以认定是故事的支柱：正是Mayuri的死，促使Okabe继续研究时间机器并最终建立Valkyrie。因此，如果能够简单地让Mayuri不死，那么Valkyrie不能建立，Suzuha也就不会乘时间机器回来进而阴差阳错拯救Kurisu的性命，这便与Lab里现在存在Kurisu相矛盾。既然Kurisu存活已经是既定事实（尽管这个果源自未来的因！），那么Mayuri就一定得死，无论她死的直接原因是什么，否则alpha线中的这个关键性因果就无法成立。在这种情况下，世界线会自动进行收束来修正这一不合理。
这个循环如此完美，因此，如果想跳出这个误打误撞进入的alpha线去拯救Mayuri，该怎么办呢？故事中的做法是找到一切的根本原因：删掉第一封D-mail，进而避免让SERN监测到这封D-mail。然而，时间旅行因此将不会出现，进而Kurisu也无法被Suzuha拯救！
个人观点：既然事件的发生已经形成一种了一种有环图，即无法做出拓扑排序，故讨论“根本原因是什么”似乎没有意义。只能理解为，删除第一封D-mail可以撬动更大的杠杆，强大到可以打破alpha世界线的因果限制，使得Okabe有机会跃迁到其它世界线上。相比而言，“仅仅在今天保护好Mayuri”这件事情过于脆弱，世界线只需动用它一点点力量，例如在明天制造一起事故，即可让事情的发展收束，因此无法对世界线造成本质的动摇。在剧情中，这量化为“变动率”是否达到1%。类似地，Ferris父亲是否存活看似决定了秋叶原是否有萌文化这件社会大事，但对于alpha世界线依旧是微不足道的，并不能影响SERN存在的结局、并不影响Kurisu生存的因果。换句话说，alpha世界线不在乎秋叶原是否还有萌文化，就像它不在乎Mayuri多活了几分钟一样，都是可以控制在1%范围内的小事而已。
一个有趣的点在于，在取消后面几封D-mail时，Okabe都是通过紧接着再发一条Revert性质的D-mail来做到的，然后就是眼前一花，世界被重建了。这给观众制造了这样的误解，即只有通过电话微波炉（或者Time Leap）才能有效地时空穿越并重建世界。然而，在撤销最早那封“Kurisu遇刺”的D-mail时，Okabe是通过黑入SERN的数据中删除记录做到的，这时候也出现了“眼前一花”并重建世界的现象，如何解读？难道SERN的IBN 5100数据库才是观测者change log的source of truth吗？其实不然，只要做出了违背因果律的事情，使得当前世界线（甚至是细粒度的、无需超过1%）无法成立，都会引发世界的重建。因此，一旦SERN不再因此去研究时间机器，则Suzuha就无法穿越时空来拯救Kurisu，alpha线无法继续成立，必然出现重建。如果这是一件小事，那么大概率就会被收束，就像Mayuri无论如何都会死那样，这条记录可能永远都因奇怪的原因无法被删掉；不过事实上，这是一件越过了1%的“大事”。
回到了故事开头的beta时间线后，Kurisu的死真的换回了和平吗？Okabe终于可以主宰自己的命运了吗？很可惜，并没有，因为他再一次看到了从（另一个）未来回来的Suzuha，这意味着世界线收束的充分原因“时间旅行导致的因果倒置”再一次发生了。Suzuha告诉他Kurisu的父亲偷窃了论文，还是造出了时间机器，并导致了第三次世界大战。Okabe大可对未来的战争漠不关心，直到他看到未来的自己告诉他，这是拯救Kurisu的最佳机会。
Beta世界线中，Okabe还是会发出“Kurisu遇刺”的D-mail，SERN也会监测到它，但这或许并不意味着世界会再次进入alpha线。这件事由于Bootstrap Paradox的原因几乎无法合理地解释：在故事的开头，这封D-mail使得Okabe误入了alpha世界线，然后alpha线改变了这封D-mail前后的事实，形成了完美的闭环，以至于“发出D-mail”这件事，作为进入这个闭环的时间点，事实上在闭环形成后并没有什么特殊性。或许是因为Kurisu死掉了，在beta世界线中，SERN监测到这封D-mail并没有造成很大的影响，最终也不是SERN造出（剽窃）了时间机器。
Alpha线中Kurisu的生-SERN造出了时间机器-Suzuha用时间机器救了Kurisu，Beta线中Kurisu的死-SERN没有造出而是父亲造出-Suzuha传送地点准确、时间机器没有救Kurisu。这两个闭环自身都是完美的，我们已经无法分辨他们中的因果关系（即世界线的”入口”），只是能在世界线已经形成之后，去解释验证这些事情是符合因果律的。也就是说，对于为什么这次Okabe就停留在了Beta线而没有进入Alpha线的问题，只能回答“没有原因”，因为Beta线本身并不存在不合理之处。或许故事开头Okabe从Beta线跳到Alpha线才是偶然中的偶然。
当然，也有一些解释认为，beta线的这封D-mail还是让Okabe进入了无尽的八月。也就是说，beta线是包含有alpha线闭环的一个更大的闭环。要想同时让Mayuri和Kurisu存活，则必须要抓住Okabe去听演讲和发送遇刺D-mail中间的时间间隔，否则又要重新上演alpha线的戏码。但由于主人公们在回到beta线后，除了发表战胜宣言和被Suzuha叫去之外没有什么额外的戏份，我们对于这时候的状况并没有详细的了解，因此无法验证这个解释的正确性。例如，删除SERN数据库的信息导致的世界重塑并不应更改当前的日期，如果解释为真，则现在理应处在beta线中的alpha线中，可以通过Kurisu在Lab中来验证。
为了拯救Kurisu，Okabe也做了一次直接的尝试，但失败了。这也是合理的，因为在beta线中，Okabe曾经亲眼看到过Kurisu倒在血泊中，并认为Kurisu大概是死掉了，这才有2035年的Okabe给2010年的自己分派拯救Kurisu并阻止三战的任务，因此Suzuha才会回来。有Suzuha回来这件事作为果，Kurisu“死”就是一个一定会被收束的因。
之所以给“死”打上引号，是因为Okabe作为一位观测者，事实上是他的主观判断构成了一个世界线的因果闭环！在游戏剧情中，这里可以强调了Okabe观测到的只是Kurisu倒在血泊中，并没有确定Kurisu是不是真的死了。因此，Okabe最后通过演戏——让活着的Kurisu倒在Okabe自己的血泊中——成功骗过了自己的观测，进而骗过了beta世界线，绕过了世界线收束的影响。然而，Kurisu活下来的事实还是让beta世界线无法成立，再一次突破了1%的屏障，进而成功进入了大团圆的Steins;Gate世界线。
另一种解释是：每个因果闭环中都有一个关键节点（即Suzuha所说的“分歧点”），当改变它们的时候，就可以轻易撬动世界线达到1%的变动率；而试图改变其它的这个事件的“果”都是徒劳，会被世界线收束。如何跳出当前的世界线，关键就是寻找到这样的分歧点。例如在alpha线中，分歧点就是SERN监测到第一封D-mail。在这样的理解下，beta线中的分歧点应该是Kurisu父亲的论文是否被烧毁。因此，当Okabe抽走金属玩具之后，世界线就应该已经变动为SG线了，即三战不会发生。然而如果完全这样理解，Kurisu的生死就是一件SG世界线不关心的小事了，大可直接救活才对，无需“欺骗自己、欺骗世界”，和故事中的渲染无法相照应。因此，个人认为最好的解释还是将上述两种结合，在接受分歧点理论的同时，强调观测者的主观逻辑合理性在世界线跳跃中发挥的作用？
总而言之，在一个世界线中，一件事情的影响会收束是比较容易解释的，即显著破坏了观测者的主观因果闭环。然而，至于如何定量地判断一个行为是“分歧点”——即达到1%的世界变化率，“趁世界线不注意”而瞬间跳脱出收束的牢笼，迁移到其它的世界线上——则不得而知。或许完全由剧情需要来决定吧。
