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希特勒開始發表越來越具有煽動性的演說，要求捷克斯洛伐克最大的少數民族，即大約310萬居住在這個國家西部、西北和西南邊界地區的蘇台德日耳曼人，應當回歸他們的祖國。德奧合并的成功，讓希特勒有把握進一步發展他的擴張主義政策。

1938年9月，英國、法國和意大利同意蘇台德地區與德國合并，作為回報，希特勒保證他将“不會再有進一步的行動”。然而這隻是希特勒擴張行動中的第一步。

1938年9月30日，德（希特勒）、意（墨索裡尼）、英（張伯倫）、法（達拉第）等歐洲四大國的領導人齊聚德國慕尼黑，簽署了著名的慕尼黑協定，該協定要求：捷克斯洛伐克必須在10月10日前将蘇台德地區割讓給德國，所有設施不得破壞，必須完好無損移交德國，如若不從，未來德國與捷克斯洛伐克爆發沖突時，英法将不會提供任何幫助！在這件事情上，沒有人征求過捷克斯洛伐克政府的意見，它不得不向國際壓力屈服。從這一刻開始，捷克斯洛伐克人意識到了，他們徹底被英法放棄了，之前的承諾到現在完全成為一紙空文。從此捷克斯洛伐克就像一條躺在砧闆上的赤鲈魚，等待着被德國一點點地分割、處理。

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波西米亞和摩拉維亞地區

3月16日，德國軍隊又開進了斯洛伐克地區，将斯洛伐克置于德軍保護之下。斯洛伐克最東側的“外喀爾巴阡自治州”趁此機會，以奧古斯丁·伊萬諾維奇·沃羅申為首的羅塞尼亞自治政府也宣布獨立，成立“喀爾巴阡烏克蘭共和國”，同時沃羅申請求德軍能提供保護，想以此來博得希特勒的歡心并能維持住自己的地位。然而沃羅申德算盤落空了，強如布拉格政府不也老老實實地聽命于元首，一個彈丸小國如何能讓希特勒放在眼裡呢。希特勒早就私下裡跟匈牙利攝政王霍爾蒂·米克洛什談好了，因為匈牙利一直溫順地聽從元首的指揮，所以元首“大度的”将外喀爾巴阡地區獎賞給匈牙利，希望他們繼續保持對德國的恭順！

同日匈牙利軍隊按計劃進入外喀爾巴阡，将其吞并。外喀爾巴阡烏克蘭的獨立僅維持了不到24小時便滅亡了，隻當了一天總統的沃羅申逃往捷克德占區，他并不清楚希特勒和匈牙利的勾結，天真地請求元首斡旋匈牙利，希特勒當然不可能去制止匈牙利人，也沒有直接拒絕沃羅申，而是将沃羅申和他的政府班子“以私人身份”安置在德軍占領下的布拉格。沃羅申在布拉格成立了所謂的“喀爾巴阡烏克蘭國會”。

自此一個具有完整主權的國家——捷克斯洛伐克第一共和國，就這麼被德國吞并。英國首相張伯倫不久前才揮舞着《慕尼黑協定》，向全世界宣告：我們這代人的和平來臨了！僅169天後，捷克斯洛伐克共和國便從歐洲的地圖上徹底消失了。

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保護國是一個名義上由納粹德國管理的自治領土，德國政府認為它是大德意志帝國的一部分。保護國擁有兩套行政班底，一套則是捷克原先的政府行政架構，前捷克斯洛伐克總統埃米爾·哈查被希特勒指定為保護國的總統，阿洛伊斯·埃利亞什擔任總理，行政班底大緻保持不變，但實際上隻是傀儡政府，整個政府幾乎沒有實權，直接聽命于柏林的指示，包括國會在内的捷克共和國的民主殘餘一律遭到廢除。現有的政治黨派被解散，并在所謂的民族團結運動的旗幟下獲得重組。

另一套行政班底則是以納粹黨衛軍和蓋世太保以及德國國防軍組成的由德國直接控制的實權政府，最高行政長官被稱為“保護國長官”或“總督”，駐地為布拉格城堡。

大約四十萬名捷克國家雇員和公務員在1939年以後仍然留任原職，與一萬一千名左右的德國民政人員一同工作，或者說成為他們的下屬。施加于保護國的這種特殊形式的行政手段，與在其他被納粹占領的歐洲地區所引入的措施有着顯著不同，畢竟捷克擁有西歐第三的軍事工業，比如歐洲最領先的武器制造商之一，位于皮爾森的斯柯達工廠，還有着大量的熟練工人，更别說此地日後将會成為德國的一部分，所以納粹對此地頗為上心。

首任保護國長官為前德國外交部長康斯坦丁·赫爾曼·卡爾·馮·牛賴特（Konstantin Hermann von Neurecht）。牛賴特是德國老牌的政治家，在興登堡時代便已經名響政壇，但自希特勒和他的納粹黨掌權以來，雖然在一定程度上配合了納粹的早期擴張，如退出國聯、公然違背《凡爾賽協定》重整德國的軍事力量，但他本質上是保守的舊式普魯士外交家，再加上經曆過第一次世界大戰，主張緩和和其他歐洲國家的關系。所以牛賴特對納粹黨的激烈行徑頗為不滿，經常反對希特勒的激進計劃，最著名的便是在1937年11月5日的“霍斯巴赫會議”上，此會希特勒向納粹高級軍政官員透露了他要在近期通過武力擴張領土的計劃，首要目标就是奧地利和捷克斯洛伐克。牛賴特聽後感到極度震驚和恐慌，因為捷克斯洛伐克擁有着歐洲第二強大的軍事體系，就連法國的軍工産業都不如，更别說英法是不可能坐視不管的，他認為以德國當時的軍事實力不足以應對一場大戰，這種激進的冒險會導緻災難性的後果（結果後來證明牛賴特判斷失誤了，德軍輕而易舉地就拿下了捷克斯洛伐克，英法等國并沒有特别激烈的動作，反而放縱了希特勒的行為，别說大戰，德軍甚至沒有開一槍便占領了一個主權國家）。

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如今，牛賴特被希特勒重新啟用，成為保護國的保護長官，他為了重新獲取元首的信任，在捷克實行了嚴格的壓制政策，如：取消新聞自由；取締前捷克的政黨和工會；推動将捷克強大的工業體系納入德國的軍事工業生産體系；推行反猶太人、反西斯拉夫人的政策；威脅全體捷克人，膽敢反抗德國的統治，破壞重要工業設施，他将進行嚴厲報複，甚至株連全體捷克人。而他也确實做到了，戰争爆發初期，為了壓制捷克的反納粹活動，他下令蓋世太保逮捕了8000名捷克斯洛伐克知名人士進行“保護性拘留”，許多人後來死于集中營，10月，捷克斯洛伐克大學的學生舉行大規模示威抗議，結果迎來了蓋世太保和黨衛軍的壓制，有一千二百名學生被監禁，九名遊行的領導人被槍決。

但牛賴特與後來的繼任者海德裡希不同，他依舊是舊普魯士外交官的思想，對捷克采取的不是一味壓制，而是一種“高壓與懷柔并存”的策略，他試圖通過扶植捷克的大資産階級和大農場主來進行統治，希望以此換取他們的合作。盡管他采取了懷柔政策，但捷克的抵抗組織（包括流亡倫敦的貝奈斯政府支持的地下運動）依然活躍，工廠怠工、破壞生産的情況嚴重，最著名的斯柯達兵工廠的産能一度隻能達到設計值的65%。因此特勒認為他“性格軟弱”，無法控制捷克的局面，因為他對當地反抗運動鎮壓不夠嚴厲，決定将其徹底棄用。1941年9月，希特勒命令牛賴特回到柏林“無限制休假”，重新任命萊因哈德·海德裡希為副保護長官，架空牛賴特。海德裡希，也就是電影反派和本次事件的主角粉墨登場。

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1941年9月29日海德裡希接替牛賴特，成為新任“波希米亞和摩拉維亞保護國”保護長官。

“新官上任三把火”，海德裡希的“第一把火”非常直接——殺人。

此時的世界局勢非常緊張，德軍閃電戰破産，蘇聯并沒有被擊垮，蘇德戰争進入相持階段。以哈裡曼為首的美國代表團、以比弗布魯克為首的英國代表團和以莫洛托夫為首的蘇聯代表團在莫斯科舉行會議，讨論如何有效地援助蘇聯作戰的問題，簽署了《關于援助蘇聯的協議》，正式确定了對蘇聯的援助計劃。德軍在正面戰場的壓力越來越大，前線軍工物資緊缺，因此德國要求所有仆從國和保護國加大生産效率，14歲以上的男人必須每天都在工廠工作，任何敢曠工、遊蕩在街上的男人将被直接送往集中營。

此舉激起了捷克人的反抗情緒，捷克地下組織也迎來了最活躍的一段時期。海德裡希不來虛的，沒有懷柔、沒有安撫，就一個字“殺”，在上任後的60天裡，蓋世太保公開處決了404人，并逮捕了4000至5000人，全部送往毛特豪森、古森等集中營，大多數也死在了集中營。一時間布拉格陰雲籠罩，恐懼的捷克人給海德裡希取了一個綽号——“布拉格屠夫”，據說念出海德裡希的名字，可止小兒夜啼。

海德裡希信奉元首的種族優越論，認為除了雅利安人之外的人種都屬于劣等民族，其中捷克人多數為西斯拉夫人，一部分靠近德國邊境的講德語的日耳曼人和日耳曼化的西斯拉夫人。海德裡希認為西斯拉夫人最為低劣，這些人将在工廠裡無限期地勞動，并被剝奪生育權，最好的結果就是死在流水線上。日耳曼化的西斯拉夫人屬于可以拯救的人種，他們可以稍微“休息幾天”，但也被剝奪了生育權，最終結果就是孤獨到死，從而達到對斯拉夫人的“淨化”。

海德裡希的“第二把火”——模範工人和削減配給。

海德裡希規定，隻要在工廠裡積極勞動，創造超過目标的成果，經過審查後将獲得“模範工人”稱号。獲得此稱号的工人将獲得更多的食物配給，如從5個面包增加為7—10個；還能額外獲得煙酒等獎勵；更擁有奢侈的每周單休日。同時削減普遍的配給，如原本每個人都能有5個面包，但被削減成3個，其他方面也都做了削減。如此捷克人不得不更加努力工作，以求能獲得“模範工人”的稱号，否則将沒有足夠的食物填飽肚子。此舉不僅總體上減少了捷克人的物資消耗，讓納粹能把重要的物資送往前線，同時還提高了工廠産量，更削減了捷克人的反抗意志，大多數人隻能埋頭苦幹以求溫飽，沒有精神再反抗納粹的統治。

海德裡希經常不帶警衛（正是這個特性讓行動刺殺小隊成功靠近海德裡希展開刺殺）巡視捷克各地，表現出一副絕對自信的模樣。他深入工廠視察，與模範工人握手、聊天，甚至親自給模範工人發工資或電影票。這種表演旨在麻痹捷克人民，讓他們相信在納粹統治下的生活反而更好，從而削弱抵抗運動的群衆基礎。

海德裡希的“第三把火”——鎮壓捷克地下抵抗組織。

此時的捷克地下抵抗組織主要有兩個組織，第一為由前捷克總統愛德華·貝奈斯為首的“倫敦捷克斯洛伐克流亡政府”，他們與英國展開合作，在英國組織流亡的捷克人組成特别行動隊，并通過情報網絡指揮捷克國内的抵抗活動。第二為由捷克斯洛伐克共産黨總書記克萊門特·哥特瓦爾德為首的“捷克斯洛伐克共産黨地下中央委員會”，他們與蘇聯展開合作，在捷克國内建立地下組織，領導工人罷工、怠工和破壞生産。兩個組織大多數情況下是獨立的，并不承認對方，隻有短暫時期組建過“民族統一陣線”。

捷克地形三面環山，中間核心區則為開闊的平原，如首都所在的波希米亞平原和核心城市的摩拉維亞平原。因此地形，捷克遊擊隊很難在核心城市展開遊擊作戰，隻能躲藏在周邊的山地裡，隻能偶爾開展間諜行動，破壞工廠和通信線之類的事。牛賴特時期因沒有及時鎮壓抵抗組織，導緻遊擊隊破壞甚重，而牛賴特也沒有對付遊擊隊的經驗，處理起來成效不顯。如今，海德裡希掌權，此人便是因為情報工作做得好才被希姆萊提點，負責籌建黨衛軍情報機構，黨衛軍的兩大組織之一的情報機構——黨衛軍保安處（SD）便是由海德裡希一手創建并發展壯大，因此鎮壓遊擊隊、反間諜等手段可是海德裡希和他部下的看家本領。在一系列的鎮壓之下，捷克本地的抵抗組織被壓制，捷克人更加順從。這讓遊擊隊恨之入骨，便開始有了暗殺海德裡希的想法。

在捷克如此的“成就”讓希特勒更加賞識海德裡希，而此時由于戰争進入相持階段，很多德國之前占領的地區陸續出現遊擊隊的活動，特别是法國。現在捷克已經被鎮壓，海德裡希完成任務，元首急需派遣他的得力幹将前往法國，讓法國人體驗一番什麼叫作痛苦，而海德裡希此去很可能不會再回到捷克，想要暗殺隻有這段時間，因此引出了後來的“類人猿行動”。