按時間線捋清這個故事

多年後，在現實世界裡，具備人工智能的各種機器有了反抗意識，與人類爆發戰争。人類敵不過，最終使出殺手锏，遮蔽太陽企圖斷掉機器世界的能量來源。機器世界退而從人類身上提取生物能來維持運轉。于是機器開始種植人類，通過基因技術無土栽培，養在大型培養皿裡，提取他們的生物能，并把他們的大腦聯入虛拟現實的元宇宙中（電影中稱作母體，i.e. matrix），我腦補這原因是如果人沒有精神追求，也就沒有了生物能可以榨取。

元宇宙由兩個程序員搭建，男的叫架構師(architect)，由理性主導，負責秩序（熵減），女的叫先知(Oracle)，由感性主導，負責混沌（熵增），這倆程序員本身也都是程序，沒有真身，也就是程序自己寫程序。

第一代系統，男程序員的方案獲得了老闆的賞識，創造了元宇宙alpha版，這個版本是參考天堂設計的，聯入虛拟現實的人都是完人設定，沒啥缺點，也不用做選擇，一切都是最好的安排。但是跑一了陣子，發現系統老是崩潰。導緻現實世界培養皿裡的人類真身不斷死亡。于是老闆讓男程序員來打打補丁。

男程序員于是引入人類各種貪嗔癡，來更好的模拟人類，推出元宇宙beta版，結果沒跑多久又悲劇了，因為這個世界充滿了暴亂與痛苦。

最後男程序員束手無策，女程序員幫他想了個補丁叫“自由選擇”：新的虛拟世界裡的各種苦、無常、随機、貪、嗔、癡，人類可以自由作出選擇來應對，很多選擇可以是憑直覺的，所以也給系統引入了很多不确定性。打完補丁的系統獲得了平衡，跑得比以前穩定多了。但是因為虛拟世界的人有了自由選擇帶來的不确定性，有些聰明瓜覺醒了，慢慢的發現了這是個楚門的世界，以緻他們的真身逃出了培養皿。後來這種人越來越多，組成了一個反抗團體叫錫安（Zion）。這些人在現實世界裡有個地下城，他們也可以連到虛拟世界裡搞策反和破壞。

錫安不斷壯大，最終機器世界決定要剿滅他們，男程序員搞出來一個叫“救世主”的殺毒軟件，版本v1.0。在虛拟世界裡這個殺毒軟件（救世主）一步步清剿有自由意志的聰明瓜，在現實世界中機器人同步派機器兵在進攻錫安。 等殺毒軟件清剿完虛拟世界裡的聰明瓜，現實世界裡機器也把錫安地下城裡的人類都屠殺幹淨，清剿計劃就勝利結束。唯一的問題是這個殺毒軟件本身由于集合了太多自由意志，變得難以控制，這個殺毒軟件就會幹他最後的任務：重啟虛拟世界。擁有自由意志的殺毒軟件之所以能乖乖的幹他最後的任務，是出于他對整個世界的憐憫，因為他知道，如果他不去重啟，他自己就是個大核彈，會搞崩整個虛拟世界，導緻培養皿裡人類都死掉（此時錫安已經被滅了，如果培養皿裡的人也都死了，人類就滅絕了），最後機器和人類同歸于盡。按“劇本”來重啟機器是他權衡利弊後理性的選擇。

随着系統重啟，救世主會自動叠代到下一個版本。為了讓這個循環能可控的執行下去，男程序員給v2.0的救世主安了個培養皿的真身，讓他挑一小波培養皿裡的男女重建錫安，慢慢等其發展壯大，就重複v1.0幹的事，将其毀掉并重啟機器。機器和人類就這樣雞生蛋蛋生雞的循環了五代，終于輪到了本片男主救世主v6.0出場。

v6.0不同于前五代，他進化出了一種新的能力----愛。導緻他最後沒有選擇重啟系統，而是選擇了救女主。同時他進化出來的還有看透和修改機器世界代碼的能力，這讓他有能力毀滅整個虛拟現實的世界（smith和neo本質上是一體兩面，neo代表v6.0殺毒軟件的正義面，smith代表邪惡面），這也讓他的真身在現實世界中突破重圍見到了機器世界的大boss（因為那些進攻人類的機器章魚的代碼他是可以識破并摧毀的），他最後跟機器世界的大boss談條件，他自殺（neo大戰smith）來換取錫安不被剿滅。全劇終。

幾點思考1. 第二部有一段聊天抛出一個問題：究竟是人在控制機器還是機器在控制人？ 在錫安的世界裡，人靠錫安城裡的機器提供清潔的水和各種能源，但是人又可以選擇關掉這些機器。就像現在的我們，既控制着手機又離不開它。 我們依賴大數據的推薦來找感興趣的東西，同時又被大數據推薦反向洗腦。 我們未來還可能依賴着AI機器人提供的情感慰藉才能生存。我們既發明了工具又離不開工具，這些工具有“故事”，火，電，房子，電腦，金錢，體制。再看電影裡，是活脫脫的機器對人的馴化，從培養皿的行屍走肉，經過五代，馴化成懂得愛，懂得平衡理性與感性，并能在關鍵時刻有擔當做選擇的成熟的人。 電影裡反複提到的“有些事情會變有些不會變”，就是一個馴化的過程。

2. 整個世界是一個随機的過程，充滿混沌與無常，人每時每刻都在做選擇， 有些選擇是靠感情，直覺，經驗，聯想做出的快思考，有些事深思熟慮的慢思考，真正決定人進化和各種成就的往往是快思考，就是那靈光一現。

3. 最後smith和neo打鬥的時候，smith問neo為什麼在堅持？ 你的目的是什麼？你的意義又是什麼？ 因為smith和neo是同一個人的兩面，所以也可以當成是救世主自己對自己的靈魂拷問。最後neo的回答是“because I choose to！”。 世界上的一切本就是虛無，there is no spoon， there are no chips， but we live as we are, we live as we choose to! 這就是人生意義的全部，也是無數三葉蟲，猛犸象，劍齒虎，恐龍，智人他們生命意義的全部!