相較于第一部，第二部少了原本現實和虛拟的母體世界的連接和發掘的問題。能看出對于此系列宏大的創想。影片開頭就對第一部中不斷在話語中提到的錫安世界開始了漫長的描繪，世界觀也有了史詩大作的野心勃勃，不再是原來電腦和真實世界間的簡單故事，加上了，關于抵抗鬥争，對抗一系列類似民族主義的框架。勢必之後都不再是簡單的“黑客帝國”，注重的不再是“黑客”而是“帝國”
隻是簡單的科幻故事也無法足夠名流影史，更是需要夾雜更多的思考。說白了，這樣的一部黑客帝國披着一層科幻的外殼，其核心絕對不像前一步所傳達的那樣，是關于哲學人類，生命意義的極緻思考。母體世界隻是線索，真正内核想要表達的是一種對人類，世界存在意義，即目的的看法。一直很喜歡先知也就是祭師的一句話
你已經做出了你的選擇，重要的不是去選擇什麼，而是知道你如此選擇背後的原因。
顯然影片在最後也做出了解答，所謂的救世主，所謂的祭師并非是什麼無所不能的奇人，而更多的可能隻是一個漏洞，他們能在虛幻世界看透這一切，但同樣能在真正真實的現實世界看透嗎？他們的出現可能本身就是意外，如通造物主所講完美的世界本身就是錯誤的，那些意外才是最佳的真實，也是促使一個想要達到真實的虛幻世界所必要的。而在電影外，我們所生活的世界就是完美的嗎，對于每一個個體來說從來不是完美的，但自然界可能回事完美的嗎，我想也未必。縱觀整個世界從遠古直到21世紀，人類的出現顯然正是所有的一切中最大的意外。如同電影中造物主對救世主的出現從來也不意外，前六任的意外出現的救世主都如約出現在這個虛化世界的上帝面前，電腦從來都沒有任何的需要損失而言，隻有對于人類，他們可能會面絕，救世主也無法逃脫選擇的魔爪。怎麼樣的選擇無非都是在尋找一個平衡。當一個人有了憐憫之心他還能做出最佳的選擇嗎，造物主作為母體中的上帝他沒有什麼在乎也不會有更多的情感對于他所矗立的周遭世界，這樣也才能發現世界真正運轉的規律，你的憐憫讓你隻是一個世俗人，他們不可能去窺探的真正的奧秘。讓我想到了科幻巨著三體裡的部分情節，當面臨平衡時，程心所流露出的憐憫，正是除了人以外生物們所缺少的，也是作為人不能轉變偉大的缺陷。而影片中尼奧更是去追尋了愛情，而不是為了對于本就缺少希望的人類們可以短暫繼續的大義去獻身。這事實上也可能是尼奧能與衆不同，能與其他救世主所區别的特質，他雖是救世主也是個人，他與其說一開始就會為了人類，事實上是為了自己。這自私嗎，其實不然吧，沒有沒一個個體的精神，也就沒有世界精神，尼奧在守護自己的世界，或者說他通過自己的經驗和感情去行事。不過最終他所探尋的遠不是自己的選擇，而是祭師所講的原因才是沖破世界真正的枷鎖。
黑客帝國1中，他們沖破真實與虛幻的束縛，第二部他們沖破的是母體中這個世界的規律和自身存在的束縛。影片中墨菲斯的形象一直是特立獨行，獨立思考不愛站邊的人設，他不像個普通戰士渴望了解到真相，他總是想象萬物總有其道理可尋，一切都有自己的目的可尋，我們的存在總有它的意義，除去完黑客，他也有圍繞着一種濃烈的神秘主義色彩，影片中的畫面是前衛的，将動作場面刻畫的絕無僅有，與任何一部曾經的科幻影片無法相比拟。而思想卻是來自人類本身，甚至關于占蔔存在這些較為微妙的現代問題上，這些現象在墨菲斯的情節中顯示的惟妙惟肖，幾乎在墨菲斯之外，每個角落都給予了了宿命論所帶來的無助，和反叛的精神。廣受觀衆喜愛的一個原因是文化的柔和，雖然可能黑客的文化來自于美國發揚與美國，影片中自然得體的為占蔔亞洲文化巧妙的運用讓所有的觀衆都不會感受到來自于好萊塢一貫爆米花風格的商業大片的傳承。中國功夫，日本武士刀，神秘占蔔未來可控等一系列讓黑客帝國本身的符号意識更加強烈，2004年周星馳的賣座喜劇大片功夫中甚至都能看到一個個黑客帝國中精彩動作戲份的影子。大片的動作戲份經常會使穩一電影或是注重表達哲思的電影深受诟病，動嘴打鬥的過多會影響叙事進度，也會使觀衆思緒的連貫性收到影響。但是若是動作戲份正是他能将這個特殊的世界觀表達清楚地重要階梯呢？在這樣的一部科幻電影中，将動作美學的運用發揮到了極緻，慢動作誇張的細節，不避諱的說科幻電影需要的動作戲份就是應該如此，不會有厭煩的感覺，而是融為成功叙述結構的一部分。
存在主義哲學是現代哲學中極其重要的一部分，它的出現更加符合現代人對于人生意義極緻的需求和思考，一部科幻片的外殼内，它将對于錫安每個人的對母體的反叛精神，主角發現自己的過程和目的在一個不同的世界中，把我們世界中奧秘成功地表達這也是其能成功的重要原因之一，我們觀看影片不隻是獲得感官上的體驗更重要的是對自身得思考，若是一部影片能兩者兼得那也就成功了一半了。更何況這些叙述并未超前而是成功直達人的内心呢？
