《灵笼》系列必须依靠漫画补充设定才能勉强看懂，即便看完漫画仍存在大量理解障碍。作品从开篇的末日科幻题材，彻底滑向无严谨铺垫的科幻修仙体系，违背了科幻创作基于现实逻辑、保持设定严谨的核心原则，与无需严密框架的玄幻修仙题材本质对立、难以兼容。主角马克被强行塑造成预言中的天选救世主，成为多方势力争夺的核心，彻底偏离人本科幻的创作内核；高人气角色查尔斯造型亮眼却戏份仓促，仅出场两集便仓促下线，角色处理极度草率。

真正理性的科幻观应秉持不偏激、不消极的中间立场，聚焦人类主动面对灾难、承担责任、解决问题的核心，而非过度渲染宗教与救世主情结。即便加入宗教元素，也不应占据叙事主体，但《灵笼》直接将救世主设定绑定主角，一二季全程回避“人类该如何面对未来”的核心命题，通篇聚焦人类内部消耗与矛盾冲突，始终缺乏一致对外、共渡末世的积极行动。作品呈现出科幻设定不严谨、人定胜天的内核无法支撑，只能依靠救世主、异能者等外力强行圆场的创作短板。

噬极兽本是人类追求长生的实验事故所造就，属于人类自身引发的末世危机，故事理应遵循“以人开始、以人结束”的逻辑，依靠人类自身力量完成自救，而非依赖超自然外力。作品中异能者设定在第一季仅短暂登场，如何觉醒、为何存在全无铺垫，设定断层严重；第一季结尾马克无合理铺垫暴走误伤大量同伴，第二季灯塔猎荒者与地面幸存者为争夺马克爆发内斗，却不交代地面势力执意留下马克的核心原因，全篇为制造冲突而冲突，充斥刻意的虐心桥段与消极压抑的赛博朋克价值观，完全背离人类自救、积极抗争的科幻底色，整体叙事令人压抑且难以认同